分享一篇 MICCAI 上关于阿尔兹海默症(AD)精准医疗的 oral 论文。
AD 的病程监控一直是个问题。
最麻烦的地方在于每个人的脑萎缩路径都完全不一样。
比如典型的就是从内侧颞叶开始扩散,
而有的又是更多集中在大脑后部的顶叶和枕叶。
现在的模型大多是独立处理大脑各个部分,忽略了不同脑区之间的关联。
也没法很好地体现基因和病理如何在个体层面影响这种动态变化。
这篇论文提出的 DISCLOSE 框架的核心思想是:
既然疾病发展是一个动态系统,那能不能直接用常微分方程 ODE 来模拟它?
在这里的 ODE 就是一套描述脑萎缩速度和方向(从什么脑区到什么脑区)的数学建模。
DISCLOSE仅通过一次基线检查,就能学习出独属于这个人的ODE轨迹方程,从而预测未来长达 5 年以上的脑萎缩情况。
分享一下它的技术实现细节:
1️⃣ 模型输入只是两个维度的静态指标。
一个是淀粉样蛋白沉积,这是 AD 的核心病理标志,数值越高意味着脑内不溶性斑块堆积越严重,这会干扰神经元功能;
另一个是 APOE4 等位基因数量,这是公认的风险基因,决定了对淀粉样蛋白沉积的耐受度,和 AD 强相关。
2️⃣ 核心映射
利用一个MLP作为映射器,把上面这两个静态指标转换成一个特定于个体的动力学矩阵。
具体是一个维度为62x62的矩阵,它定义了大脑62个区域之间,谁是因谁是果,以及影响的强弱。
3️⃣ 轨迹输出
MLP 只需推理一次,这个矩阵会给到ODE Solver,驱动 ODE 运行。
从最开始的脑体积状态 x(0),一个包含 62 个数字的向量,每一个数字对应一个脑区(如海马体、杏仁核等)在第一天检测时的 NP 值 (规范化百分位数,简称 NP)。
最终输出全脑 62 个区域在未来不同时间点的 NP 值。
这里简单解释下 NP 值,它代表一个人脑体积在同年龄同性别健康人群中的相对位置。数值越低,说明萎缩程度越严重。
整个流程是监督学习,所以反向传播需要跨越整个 ODE 的求解过程,以此更新 MLP。
预测轨迹与真实轨迹之间的差异用 L1 损失函数来衡量。
另外还用了两个额外的约束,具体可以看看原论文。
实验用了 ADNI 数据库里 371 个人的纵向数据做验证。
结果显示,在预测超过三年的长期轨迹时,DISCLOSE 明显优于传统的 SINDy 算法。
而且它的可解释性很强,能对应上临床直觉。
比如模型发现,在高风险组(APOE4 纯合子+高淀粉样蛋白)中,颞叶萎缩会从内侧迅速扩散到外侧,这和典型 AD 的进展模式完全吻合。
而在低淀粉样蛋白组中,模型则捕捉到了非典型的后部脑区萎缩模式。
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